Анализ мутаций в гене BRAF при меланоме для определения чувствительности к таргетным препаратам

BRAF мутация при меланоме

Раздел находится в стадии наполнения

BRAF мутация при paке

Эффективность лечения пациента с диагностированным paком во многом зависит от результатов генетических исследований. При обнаружении молекулярных механизмов возникновения опухоли рациональные терапевтические методы воздействия на злокачественное образование позволяют значительно улучшить качество и продолжительность жизни пациента.

Изменения в гене BRAF хаpaктерны для нескольких типов oнкoлoгических заболеваний. Системные нарушения гена происходят на уровне передачи сигналов. Мутировавшая часть ДНК запускает неконтролируемый процесс деления клеток, который и приводит к образованию опухоли.

BRAF мутация встречается при paке кожи, колоректальном paке, немелкоклеточных опухолях легких и некоторых видах злокачественных образований щитовидной железы. В качестве блокаторов сигнального каскада используются низкомолекулярные ингибиторы фермента. Они предотвращают деление клеток и разрастание опухолевой ткани.

Методы определения мутации

Основным способом исследования в лаборатории Центра Инновационных Биотехнологий Аллель является пиросеквенирование. Данный метод позволяет выявить различные виды мутаций в исследуемом образце, что помогает врачу подобрать оптимальный способ лечения для каждого конкретного пациента.

Материалом для проведения анализа служит ДНК опухолевой ткани. Биоптат новообразования помещается в парафиновый блок или передается в емкости со специальным раствором, из которого изготавливаются блоки для долгосрочного хранения и возможности проведения других исследований.

Мутация гена BRAF V600E

Наиболее частые изменения происходят в кодоне 600 15-го экзона. При этом виде мутации привычная аминокислота валин заменяется на другую. Мутация именуется V600E, последняя буква в названии означает аминокислоту, заменяющую валин.

Изменения в BRAF V600E хаpaктерны для меланомы, его обнаруживают у подавляющего большинства пациентов (40-70%). В случае такой мутации в кодоне 600 аминокислота валин заменяется на глутаминовую кислоту. Структурное изменение ДНК этого типа является доминирующим и встречается в 60-90% случаев меланомы.

Рекомендации российского общества клинической oнкoлoгии предлагают эффективные варианты лечения для пациентов с BRAF мутацией V600E.

BRAF мутация при меланоме

Меланома – разновидность paка кожи, зарождающаяся в пигментных клетках меланоцитах. Большая часть новообразований проявляется спорадически, однако некоторые виды меланомы могут развиваться в родинках.

Отличительной особенностью меланом являются неровные края и неправильные формы. Размер новообразования может варьироваться от нескольких миллиметров до нескольких сантиметров в диаметре. Они могут иметь разное окрашивание – черные, коричневые, красные, синие и белые.

Меланома возникает на коже, но может затрагивать и другие ткани. Достаточно распространена увеальная меланома (поражение оболочки глаз), а также опухоль в слизистых оболочках, выстилающих различные органы человека.

Новообразования влияют только на эпидермис, но глубокое прорастание в несколько слоев кожи может стать причиной метастазирования на другие участки тела.

Опухоли чаще всего обнаруживаются на спине у мужчин и на ногах у женщин. Средний возраст развития заболевания — от 50 до 70 лет и все чаще встречается у молодого населения. Пигментированные кожные образования, а также родинки влияют на риск возникновения меланомы. Риск повторного развития новообразований у людей, ранее страдавших таким недугом в несколько раз больше, чем у пациентов с прежде не диагностированным заболеванием. Больные с меланомой выживают в 90% случаев.

Мутацию гена c-KIT выявляют у 15% больных. Такой маркер хаpaктерен для заболевания, затрагивающего слизистые оболочки гeнитaлий, прямой кишки, носовых ходов и полости рта. Изменение также выявляется при меланоме, расположенной на ладонях и ногтях.

При выявлении c-KIT мутации при меланоме назначают для терапии препараты-ингибиторы c-KIT. В 30% случаев лечение имеет положительный эффект.

Сколько стоит анализ BRAF мутации при меланоме

Центр Инновационных Биотехнологий Аллель предлагает широкий спектр генетических исследований. В лаборатории, где можно сделать анализ мутации генов BRAF и c-KIT, используется точный и достоверный метод исследования – пиросеквенирование. Для диагностики необходимо предоставить образец опухолевой ткани. Уточнить детали заказа, узнать стоимость и оставить заявку можно на сайте, заполнив короткую форму, или позвонив по телефону: +7 (495) 780-92-96.

Анализ мутаций в гене BRAF при меланоме для определения чувствительности к таргетным препаратам

Ген BRAF кодирует внутриклеточный белок, который является компонентом сигнальных каскадов RAS-MAPK и RAS-MEK-ERK, регулирующих пролиферацию клетки в ответ на внешние митогенные стимулы. Белок BRAF имеет киназную активность которая необходима для передачи сигнала при его активации. Соматические активирующие мутации BRAF часто встречаются при меланоме кожи, опухолях щитовидной железы, paке яичников, paке толстой и прямой кишки. Наиболее частой активирующей мутацией гена BRAF является точечная нуклеотидная замена c.1799T>A которая соответствует мутации V600E в белке BRAF. При меланоме кожи мутация V600E составляет 80-90% мутаций BRAF; кроме этой мутации встречаются V600K (10-20%), V600R, V600D, V600E2 и другие редкие мутации.

Читать еще:  Чем можно снять зуд: лекарства и народные средства

Что такое Вемурафениб, Дабрафениб и Траметиниб

Препараты Зелбораф/Вемурафениб (Zelboraf/vemurafenib) (Roche), и Тафинлар/ Дабрафениб (Tafinlar/ dabrafenib) (GlaxoSmithKline) являются ингибиторами киназной активности BRAF. Эти ингибиторы селективно подавляют киназную активность белка BRAF с мутациями в положении V600 по сравнению с белком без мутаций. Клинические испытания показали высокую эффективность препаратов Вемурафениб и Дабрафениб для химиотерапии метастатической меланомы кожи с мутациями V600E или V600K. В ЕЭС Европейским медицинским агенством (ЕМА) разрешено применение Вемурафениба и Дабрафениба для химиотерапии метастатической меланомы с мутацией BRAF-V600. В США Управление по надзору за качеством пищевых продуктов и лекарственных средств (FDA) разрешило применение этих препаратов для лечения пациентов с метастатической меланомой с мутацией BRAF-V600E. Кроме меланомы кожи клинические исследования показали активность Вемурафениба и Дабрафениба и при других солидных опухолях с мутацией BRAF-V600E (paке щитовидной железы, немелкоклеточном paке легких).

Кому рекомендуется BRAF-тест

Тест на мутации гена BRAF рекомендуется пациентам с меланомой кожи, опухолях щитовидной железы, paком яичников, paком толстой и прямой кишки для оценки возможности терапии препаратами Вемурафениб и Дабрафениб.

Какие мутации в гене BRAF являются показанием к применению препаратов Вемурафениб и Дабрафениб

Мутация BRAF V600E при метастатической меланоме кожи является показанием к применению препаратов Вемурафениб и Дабрафениб в США. В ЕЭС показания к применению не ограничиваются мутацией V600E, а включают и более редкие мутации в положении V600. В клинических испытаниях мутация BRAF V600E коррелирует с наиболее высокой чувствительностью меланомы кожи к лечению препаратами Вемурафениб и Дабрафениб. Кроме мутации V600E доклинические и клинические исследования показали активность этих препаратов на клетках несущих мутации BRAF V600K, V600R, V600D и другие редкие мутации в положении V600.

Какие методы применяются в лаборатории генодиагностики БиоЛинк для BRAF теста

В лаборатории генодиагностики «БиоЛинк» используется метод аллель-специфической ПЦР в режиме реального времени с целью выявления мутации V600E/K/E2/D в гене BRAF. Чувствительность теста позволяет выявить наличие 1% мутантной ДНК BRAF в опухоли, что значительно выше чувствительности прямого секвенирования ДНК.

Материалы для исследования

В качестве материала для анализа может использоваться ДНК опухолей, выделенная из свежезамороженной ткани или ткани фиксированной формалином и заключенной в парафин.

Популярное видео

Мутация гена BRAF при меланоме

Частота и виды мутаций в гене BRAF

Частота мутаций в гене BRAF при меланоме кожи, по данным разных исследователей, варьирует от 30-40% до 70%. Наиболее распространенной (69-94% случаев) разновидностью BRAF-мутаций является V600E – замена валина на глутамин в 600-м кодоне. Эта мутация представляется доминирующей, но далеко не единственной разновидностью нарушений BRAF [14, 15]. Второй по частоте является мутация V600К – ее частота может достигать 5-10%. Мутации V600D и V600R встречаются значительно реже.

Cтатус мутации гена BRAF и выбор тактики лечения

За последние годы достигнуты значительные успехи в изучении патогенетических основ развития меланомы и сделан огромный шаг к выявлению новых потенциальных молекулярных мишеней. Открытие молекулярной мишени BRAF и понимание ее роли в патогенезе меланомы легли в основу разработки нового класса препаратов – низкомолекулярных ингибиторов мутированного фермента BRAF. Использование этих препаратов позволяет блокировать патологически активированный сигнальный каскад, который запускается мутацией BRAF V600, и, таким образом, тормозить развитие опухоли. Следует особо отметить, что воздействие данной группы препаратов на опухолевые клетки с нормальной последовательностью BRAF, напротив, может сопровождаться патологической активацией каскада RAS-RAF-MEK-ERK и провоцировать рост меланомы. Этот феномен свидетельствует об исключительной важности достоверной диагностики статуса гена BRAF.

BRAF ингибиторы не должны использоваться в тех случаях, когда статус мутации BRAF не определен или мутация не обнаружена!

Следует подчеркнуть, что ингибиторы BRAF и MEK зарегистрированы к применению только для терапии метастатической формы меланомы. В настоящее время отсутствуют данные по использованию ингибиторов BRAF и MEK в адъювантном режиме, поэтому они не могут быть рекомендованы пациентам, перенесшим (условно-)радикальное удаление первичной меланомы и метастических очагов.

В рандомизированных клинических исследованиях ингибиторы BRAF – вемурафениб и дабрафениб – продемонстрировали значительное преимущество по сравнению со стандартной химиотерапией в отношении частоты объективных ответов, продолжительности жизни без прогрессирования и общей продолжительности жизни у пациентов с метастатической меланомой и подтвержденной мутацией гена BRAF, ранее не получавших системного лечения (см. рис. 2). Полученные результаты привели к пересмотру международных клинических рекомендаций, которые включили эти препараты в современные стандарты лечения метастатической меланомы кожи с BRAF мутацией.

Читать еще:  Дегтярный шампунь от перхоти — инструкция по применению и популярные шампуни

Результаты последних исследований показали, что двойное ингибирование сигнального пути MAРK, которое достигается при одновременном использовании ингибиторов BRAF и MEK, обладает более высокой эффективностью по сравнению с ингибитором BRAF в монорежиме. Важно отметить, что помимо более высокой эффективности комбинация препаратов снижает вероятность развития резистентности к проводимой терапии и отдельных нежелательных явлений, в том числе плоскоклеточного paка кожи. В рамках клинического исследования coBRIM было подтверждено, что комбинированная терапия с использованием препаратов вемурафениб и кобиметиниб в 90% случаев позволяет достичь ответа на терапию у больных BRAF+ метастатической меланомой. У каждого второго пациента более года отсутствовали признаки прогрессирования заболевания, а общая выживаемость приближалась к 2 годам (рис. 3).

Сходные результаты были продемонстрированы в исследованиях дабрафениба и траметиниба. В частности, исследование COMBI-V (дабрафениб+траметиниб vs монотерапия вемурафенибом) продемонстрировало значимой увеличение общей продолжительности жизни у пациентов, получавших комбинированную терапию, по сравнению с применением вемурафениба без ингибитора MEK (25.6 мес. vs 18 мес.; рис. 4, табл. 1). В клиническом испытании COMBI-D сравнивалась эффективность комбинации дабрафениб+траметиниб по отношению к монотерапии дабрафенибом в сочетании с плацебо. Примечательно, что в этом исследовании были зарегистрированы пpaктические идентичные показатели общей продолжительности жизни (25.1 мес. vs 18.7 мес.; рис. 5, табл. 1).

Определение статуса гена BRAF является обязательным компонентом выработки тактики лечения всех пациентов с неоперабельной/метастатической меланомой кожи.

Рисунок 2. Результаты рандомизированного исследования BRIM-3: сравнение эффективности вемурафениба и дабрафениба в 1-й линии терапии метастатической меланомы с мутацией BRAF.

Рисунок 3. Результаты рандомизированного исследования coBRIM: сравнение эффективности комбинации кобиметиниба+вемурафениба и вемурафениба+плацебо в 1-й линии терапии метастатической меланомы с мутацией BRAF.

Рисунок 4. Результаты клинического исследования COMBI-V: (дабрафениб+траметиниб vs монотерапия вемурафенибом).

Рисунок 5. Результаты клинического испытания COMBI-D: эффективность комбинации дабрафениб+траметиниб по отношению к монотерапии дабрафенибом в сочетании с плацебо.

Сводные данные по всем исследованиям представлены в таблице 1.

BRAF мутация при меланоме

Меланома считается коварной болезнью. Часто она быстротечна, склонна к рецидивам, имеет несколько форм и трудно диагностируется на начальных стадиях. Развиваясь, paковые клетки мутируют. Для разработки курса лечения необходимо понимать, какую именно мутацию прошла болезнь в конкретном случае. Если вовремя подобрать препараты, жизнь пациента можно спасти.

Что это такое BRAF?

Чаще всего при развитии меланомы у больных встречаются следующие виды мутации: BRAF, c-Kit, NRAS. Браф мутация встречается в 45―65% случаев. Для проведения корректной таргетированной терапии врачу необходимо понимать, произошла ли мутация клеток и в каком русле. Это исследование проводится на этапе образования метастазов, когда стандартных методов лечения уже недостаточно.

Браф — ген, отвечающий за сигнальный путь в клетке. В здоровом состоянии этот путь неактивен, однако при появлении мутации продуцируется активированный белок, который вызывает избыточный перенос к факторам роста. Как результат — клетки размножаются в ускоренном темпе, что приводит к неконтролируемому росту paковой опухоли.

Причина возникновения браф мутаций при меланоме

Меланома, как и любой другой тип paка вызывается патологией генов, отвечающих за деление злокачественных клеток. Как правило, таких мутаций должно быть около 4―6-ти для запуска болезни. Однако существует определенный тип генов, которых достаточно для начала неконтролируемого деления клеток опухоли. К ним относится BRAF. Если у пациента мутирует ген BRAF, его болезнь называют BRAF-положительной меланомой.

Диагностика и анализы

По международным стандартам анализ проводится в обязательном порядке на 3-й и 4-й стадиях paка. Возможна диагностика на 1-й и 2-й стадии, если врач наблюдает быстрое течение болезни. Для выявления гена braf мутации проводятся молекулярные пробы, а именно тест на V600E и полимеразная цепная реакция в режиме реального времени. Алгоритм сдачи биопробы:

1. Используется ткань опухоли, которая была взята у больного путем хирургического иссечения для гистологического исследования. При этом могут использоваться первичные ткани с меланомой на коже и метастазные образования.
2. Материал для анализа доставляется в лабораторию в формалине или сразу же после операции.
3. Лаборант фиксирует на стеклах парафиновые блоки. При этом должна быть четко видна граница между здоровой и больной тканями образца. Если это условие выполнить невозможно, используют парафиновые блоки с генетическим материалом.

Такое исследование особо важно для пациентов, у которых нельзя удалить paковые ткани. Если в городе проживания пациента это исследование не проводится, больной может самостоятельно взять парафиновый блок с образцом клеток и перевезти его в город, где этот анализ возможен. Для обеспечения точности анализа должно быть более 20% злокачественных клеток.

Читать еще:  Инкубационный период чесотки у людей

Своевременная диагностики BRAF мутации меланомы стоит пациенту жизни. Вернуться к оглавлению

Важность ранней диагностики

Меланома развивается быстро. Очагом чаще являются родинки, имеющиеся на теле каждого человека. Развитие заболевания происходит на ДНК уровне, поэтому регулярные осмотры кожных покровов крайне важны. Если заболевание установлено, положительный результат анализа гена BRAF говорит лечащему врачу о необходимости коррекции курса лечения. При меланоме время — враг пациента. Четких норм количества выявленных мутаций не существует. Исследование проводят исключительно для определения эффективности выбранного курса препаратов и процедур. Если установить диагноз на ранних стадиях, меланома хорошо реагирует на таргетное лечение.

Отсутствие в образце анализа мутации свидетельствует об эффективности выбранного курса лечения.

Лечение мутации

Получив сведения о braf гене на этапе моделирования курса терапии, врач сможет прописать новейшие лекарственные средства, угнетающие активность мутации и увеличивающие шансы пациента. Несколько лет назад медиками Израиля успешно внедрены методики, при которых атака на paковые клетки проводится вне зависимости от их локализации. При этом препарат действует локально, не задевая здоровых клеток, как при стандартной химиотерапии. Уменьшение побочных эффектов по сравнению с традиционными методами лечения — еще одно преимущество локального лечения. Прием этих препаратов значительно продлевает жизнь paковых больных.

Онкологическая клиника в Москве

+7(925)191-50-55

Анализ мутации гена BRAF

За последние десятилетия учеными был обнаружен ряд генетических мутаций, предрасполагающих к возникновению меланомных опухолей.

При этой онкопатологии, впрочем, как и при прочих заболеваниях подобного рода, перерождение здоровых клеток в paковые сопряжено с изменениями генов, ответственных за деление клеток, их пролиферацию и/или апоптоз (естественное самоуничтожение).

Как показывают наблюдения, для злокачественной трaнcформации необходимо в среднем от четырех до шести таких мутаций. Однако существуют гены, влияние которых на перечисленные процессы так велико, что одной-единственной мутации в них оказывается достаточно для злокачественного перерождения и дальнейшего поддержания роста опухолевого новообразования без внешних природных сигналов.

Один из этих генов – BRAF (серин/треонин-киназа), мутации в котором, согласно статистике, обнаруживаются приблизительно у 40-70% больных меланомой. BRAF входит в число протеинов, формирующих основной сигнальный путь, активирующий рост и отвечающий за сохранение клеточных элементов.

В норме с EGF-рецептором на поверхности клеточной мембраны взаимодействует специфический эпидермальный фактор роста, в результате чего происходит запуск определенного сигнала, передающегося, как известно, по цепочке белков (в т.ч. и по BRAF-гену) к ядру клетки.

Когда же BRAF-ген мутирует, он начинает передавать ростовой сигнал беспрерывно, вне зависимости от упомянутых внешних сигналов, что приводит к аномальному, неконтролируемому делению, размножению клеток и, следовательно, появлению опухолевых образований.

Диагностируют мутации гена BRAF путем постановки молекулярных проб: теста на мутации в структуре гена BRAF V600E, ПЦР в режиме RT (реального времени). Чтобы исследование на наличие мутации было достоверным, нужно свыше 20% злокачественно-перерожденных клеток.

Для анализа берут опухолевую ткань, которая предварительно была иссечена во время хирургического вмешательства и изучалась в гистологической лаборатории.

Поэтому пациенту нужно взять в ней парафиновый блок с фрагментами новообразования и предоставить его на консультацию экспертам молекулярной лаборатории.

Кстати, следует отметить, что для данного исследования вполне подходит и первичная меланомная опухоль на кожных покровах, и ее метастатические очаги.

Для качественного выполнения молекулярного анализа на мутацию BRAF-гена обязательно требуется достаточное количество сохранного генетического материала. Таким образом, с одной стороны, крайне важно чтобы в гистологических лабораториях были соблюдены все правила обработки биоматериала, а с другой, чтобы в молекулярной лаборатории имелось высококачественные реактивы и оборудование, что даст возможность выявить мутации гена в наименьшем объеме исходного материала.

Меланомные опухоли, при которых у пациентов выявляется патологический BRAF-ген, принято называть BRAF-позитивными. По мнению специалистов очень важно сделать все необходимые анализы на определение указанной мутации у лиц с распространенными вариантами меланомы и в тех ситуациях, когда злокачественное новообразование не может быть адекватно удалено хирургическим путем.

Оценив статус мутации на этапе разработки индивидуальной лечебной тактики, доктора смогут назначить больному инновационные препараты, способные блокировать измененный ген и в значительной мере повысить эффективность лечения. Эти современные лекарственные средства, которые не так давно были разработаны и внедрены в мировую oнкoлoгическую пpaктику, воздействуют на опухоль независимо от того, где она располагается. Их прием позволяет существенно увеличить продолжительность жизни больных с распространенными меланомами.

+7(925)191-50-55

г. Москва, Духовской переулок, 22б